Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KPNA3O00505 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KPNA3O00505 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KPNA3O00505 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KPNA3O00505 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KPNA3O00505 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KPNA3O00505 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KPNA3O00505 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KPNA3O00505 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KPNA3O00505 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms