Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1D1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1D1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1D1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1D1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1D1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1D1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1D1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1D1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1D1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1D1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H7C1D1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H7C1D1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H7C1D1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.27■■□□□ 1
H7C1D1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
H7C1D1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H7C1D1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H7C1D1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
H7C1D1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
H7C1D1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H7C1D1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
H7C1D1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
H7C1D1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
H7C1D1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H7C1D1 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
H7C1D1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H7C1D1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H7C1D1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
H7C1D1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.27■■□□□ 1
H7C1D1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
H7C1D1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H7C1D1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H7C1D1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
H7C1D1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
H7C1D1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
H7C1D1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
H7C1D1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
H7C1D1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1D1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1D1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1D1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1D1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1D1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1D1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1D1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1D1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1D1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1D1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1D1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1D1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1D1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1D1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1D1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1D1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1D1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1D1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1D1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1D1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1D1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1D1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1D1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1D1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1D1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1D1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1D1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C1D1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C1D1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C1D1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C1D1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C1D1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C1D1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C1D1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C1D1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C1D1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C1D1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C1D1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C1D1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C1D1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C1D1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C1D1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C1D1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C1D1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C1D1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C1D1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C1D1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C1D1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C1D1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C1D1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C1D1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C1D1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C1D1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C1D1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C1D1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C1D1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C1D1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C1D1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C1D1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C1D1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C1D1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C1D1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms