Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms