Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms