Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA3AA6NCI4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms