Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD54BQ9Y620 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms