Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms