Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CTNNA3Q9UI47 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNA3Q9UI47 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms