Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms