Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms