Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00474Q9P2X8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms