Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms