Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms