Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf12Q9NSK7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms