Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms