Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASS4Q9NQ75 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms