Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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RAB9BQ9NP90 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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RAB9BQ9NP90 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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