Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms