Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms