Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SHANK2-AS3Q9BTD1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms