Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms