Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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