Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAT1Q99536 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms