Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CITED4Q96RK1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms