Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD4LQ96PU5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD4LQ96PU5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms