Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKNOX2Q96KN3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKNOX2Q96KN3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms