Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTP4Q96DX8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms