Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms