Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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ZNF248Q8NDW4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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ZNF248Q8NDW4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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ZNF248Q8NDW4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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ZNF248Q8NDW4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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ZNF248Q8NDW4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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ZNF248Q8NDW4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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ZNF248Q8NDW4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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ZNF248Q8NDW4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF248Q8NDW4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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