Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
P3H3Q8IVL6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC28■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC28■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC28■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
P3H3Q8IVL6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms