Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms