Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUFY3Q7L099 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUFY3Q7L099 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms