Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT07

TBC1D9, TBC1 domain family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D9Q6ZT07 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBC1D9Q6ZT07 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms