Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms