Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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