Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF2Q5BJF6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms