Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SP6Q3SY56 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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