Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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E2F4Q16254 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
E2F4Q16254 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
E2F4Q16254 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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