Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
USF2Q15853 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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