Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms