Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK3Q15120 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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