Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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