Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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