Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMD6Q15008 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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