Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFIXQ14938 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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