Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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