Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RRP1BQ14684 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RRP1BQ14684 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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