Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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