Protein–RNA interactions for Protein: Q13206

DDX10, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX10Q13206 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX10Q13206 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX10Q13206 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms