Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms